lsaパッケージインストール

R

lsaパッケージをインストする際のJAVA設定の備忘録
R version 2.14.1

install.packages("lsa")

を実行すると下記のようなエラーが出た。

Make sure you have Java Development Kit installed and correctly registered in R.
If in doubt, re-run "R CMD javareconf" as root.
  
ERROR: configuration failed for package ‘rJava’
* removing ‘/home/yamaguchi/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.14/rJava’
ERROR: dependency ‘rJava’ is not available for package ‘RWekajars’
* removing ‘/home/yamaguchi/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.14/RWekajars’
ERROR: dependencies ‘RWekajars’, ‘rJava’ are not available for package ‘RWeka’
* removing ‘/home/yamaguchi/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.14/RWeka’
ERROR: dependencies ‘RWeka’, ‘rJava’ are not available for package ‘Snowball’
* removing ‘/home/yamaguchi/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.14/Snowball’
ERROR: dependencies ‘Snowball’, ‘RWeka’ are not available for package ‘lsa’
* removing ‘/home/yamaguchi/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.14/lsa’
  
 ダウンロードされたパッケージは、以下にあります
        ‘/tmp/Rtmp1qDjRx/downloaded_packages’
 警告メッセージ：
1: In install.packages("lsa") :
   パッケージ '‘rJava’' のインストールは、ゼロでない終了値をもちました
2: In install.packages("lsa") :
   パッケージ '‘RWekajars’' のインストールは、ゼロでない終了値をもちました
3: In install.packages("lsa") :
   パッケージ '‘RWeka’' のインストールは、ゼロでない終了値をもちました
4: In install.packages("lsa") :
   パッケージ '‘Snowball’' のインストールは、ゼロでない終了値をもちました
5: In install.packages("lsa") :
   パッケージ '‘lsa’' のインストールは、ゼロでない終了値をもちました

関係するのか分からないが、

sudo update-alternatives --config java

でopenJDKからSUN JDK6に変更して、

sudo R CMD javareconf

を実行して、再度

install.packages('lsa', dependencies=T)

でインストール成功。